Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POU3F4P49335 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POU3F4P49335 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms