Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRIP1P48552 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRIP1P48552 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRIP1P48552 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms