Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRGP48443 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRGP48443 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRGP48443 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRGP48443 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRGP48443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRGP48443 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRGP48443 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRGP48443 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRGP48443 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRGP48443 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRGP48443 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRGP48443 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRGP48443 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRGP48443 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RXRGP48443 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRGP48443 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRGP48443 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRGP48443 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRGP48443 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RXRGP48443 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RXRGP48443 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRGP48443 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRGP48443 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RXRGP48443 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRGP48443 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRGP48443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRGP48443 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRGP48443 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RXRGP48443 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRGP48443 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RXRGP48443 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RXRGP48443 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRGP48443 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRGP48443 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRGP48443 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRGP48443 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRGP48443 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRGP48443 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRGP48443 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRGP48443 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRGP48443 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRGP48443 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRGP48443 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRGP48443 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRGP48443 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRGP48443 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRGP48443 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRGP48443 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRGP48443 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRGP48443 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRGP48443 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRGP48443 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRGP48443 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms