Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP5P45974 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP5P45974 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP5P45974 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
USP5P45974 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP5P45974 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP5P45974 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP5P45974 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP5P45974 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP5P45974 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP5P45974 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP5P45974 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP5P45974 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP5P45974 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP5P45974 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP5P45974 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP5P45974 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP5P45974 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USP5P45974 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP5P45974 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP5P45974 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP5P45974 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP5P45974 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP5P45974 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP5P45974 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP5P45974 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP5P45974 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP5P45974 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP5P45974 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP5P45974 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP5P45974 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP5P45974 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP5P45974 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP5P45974 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP5P45974 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP5P45974 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP5P45974 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP5P45974 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP5P45974 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP5P45974 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP5P45974 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP5P45974 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP5P45974 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP5P45974 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP5P45974 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP5P45974 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP5P45974 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
USP5P45974 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP5P45974 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP5P45974 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP5P45974 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP5P45974 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP5P45974 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP5P45974 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP5P45974 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP5P45974 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP5P45974 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP5P45974 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP5P45974 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP5P45974 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP5P45974 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP5P45974 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP5P45974 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP5P45974 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP5P45974 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP5P45974 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP5P45974 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP5P45974 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP5P45974 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP5P45974 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP5P45974 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP5P45974 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP5P45974 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP5P45974 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP5P45974 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP5P45974 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP5P45974 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP5P45974 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP5P45974 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP5P45974 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP5P45974 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms