Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFMP43652 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFMP43652 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFMP43652 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFMP43652 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFMP43652 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AFMP43652 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFMP43652 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFMP43652 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFMP43652 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFMP43652 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFMP43652 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFMP43652 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFMP43652 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFMP43652 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AFMP43652 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFMP43652 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFMP43652 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFMP43652 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFMP43652 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFMP43652 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFMP43652 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFMP43652 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFMP43652 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFMP43652 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AFMP43652 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFMP43652 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFMP43652 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFMP43652 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFMP43652 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFMP43652 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFMP43652 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFMP43652 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFMP43652 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFMP43652 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFMP43652 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFMP43652 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AFMP43652 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFMP43652 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFMP43652 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFMP43652 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFMP43652 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFMP43652 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFMP43652 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
AFMP43652 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFMP43652 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFMP43652 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFMP43652 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFMP43652 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFMP43652 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AFMP43652 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFMP43652 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFMP43652 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFMP43652 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFMP43652 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFMP43652 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFMP43652 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFMP43652 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFMP43652 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFMP43652 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFMP43652 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFMP43652 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFMP43652 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms