Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRATP43155 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRATP43155 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRATP43155 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRATP43155 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRATP43155 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRATP43155 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRATP43155 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRATP43155 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRATP43155 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRATP43155 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRATP43155 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRATP43155 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRATP43155 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRATP43155 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRATP43155 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRATP43155 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRATP43155 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRATP43155 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRATP43155 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRATP43155 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRATP43155 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRATP43155 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRATP43155 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRATP43155 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRATP43155 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRATP43155 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRATP43155 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRATP43155 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRATP43155 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRATP43155 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRATP43155 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRATP43155 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRATP43155 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRATP43155 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRATP43155 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRATP43155 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRATP43155 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRATP43155 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRATP43155 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRATP43155 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRATP43155 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRATP43155 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRATP43155 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRATP43155 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRATP43155 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRATP43155 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRATP43155 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRATP43155 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRATP43155 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRATP43155 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRATP43155 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRATP43155 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRATP43155 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRATP43155 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRATP43155 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRATP43155 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRATP43155 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRATP43155 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRATP43155 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRATP43155 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRATP43155 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRATP43155 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRATP43155 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRATP43155 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRATP43155 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRATP43155 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRATP43155 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRATP43155 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRATP43155 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms