Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC1A4P43007 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC1A4P43007 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC1A4P43007 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC1A4P43007 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC1A4P43007 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms