Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CBP42338 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CBP42338 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CBP42338 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms