Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBRP36941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBRP36941 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBRP36941 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBRP36941 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBRP36941 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBRP36941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBRP36941 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBRP36941 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBRP36941 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBRP36941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBRP36941 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBRP36941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBRP36941 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBRP36941 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBRP36941 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBRP36941 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBRP36941 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBRP36941 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBRP36941 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBRP36941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBRP36941 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBRP36941 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBRP36941 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBRP36941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBRP36941 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBRP36941 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBRP36941 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBRP36941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBRP36941 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBRP36941 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBRP36941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBRP36941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBRP36941 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBRP36941 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBRP36941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBRP36941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBRP36941 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBRP36941 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBRP36941 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBRP36941 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBRP36941 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBRP36941 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBRP36941 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBRP36941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBRP36941 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBRP36941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBRP36941 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBRP36941 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTBRP36941 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTBRP36941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBRP36941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBRP36941 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBRP36941 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBRP36941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBRP36941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBRP36941 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBRP36941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBRP36941 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms