Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM23P36406 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM23P36406 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM23P36406 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM23P36406 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms