Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH11P35749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYH11P35749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYH11P35749 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYH11P35749 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYH11P35749 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYH11P35749 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH11P35749 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH11P35749 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH11P35749 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH11P35749 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH11P35749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH11P35749 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH11P35749 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH11P35749 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH11P35749 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH11P35749 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH11P35749 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH11P35749 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH11P35749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH11P35749 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH11P35749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH11P35749 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH11P35749 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH11P35749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH11P35749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH11P35749 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MYH11P35749 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH11P35749 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYH11P35749 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH11P35749 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH11P35749 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH11P35749 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH11P35749 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH11P35749 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH11P35749 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH11P35749 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH11P35749 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH11P35749 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH11P35749 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH11P35749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH11P35749 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH11P35749 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH11P35749 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH11P35749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH11P35749 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH11P35749 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MYH11P35749 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYH11P35749 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
MYH11P35749 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH11P35749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH11P35749 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH11P35749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH11P35749 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH11P35749 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH11P35749 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH11P35749 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH11P35749 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH11P35749 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH11P35749 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH11P35749 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH11P35749 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH11P35749 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH11P35749 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH11P35749 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH11P35749 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH11P35749 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH11P35749 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH11P35749 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH11P35749 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYH11P35749 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH11P35749 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms