Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX6P35712 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX6P35712 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX6P35712 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX6P35712 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOX6P35712 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX6P35712 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX6P35712 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX6P35712 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX6P35712 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX6P35712 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX6P35712 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX6P35712 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX6P35712 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX6P35712 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX6P35712 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX6P35712 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX6P35712 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX6P35712 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX6P35712 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX6P35712 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX6P35712 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX6P35712 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX6P35712 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX6P35712 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX6P35712 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX6P35712 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX6P35712 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX6P35712 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX6P35712 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX6P35712 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX6P35712 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX6P35712 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX6P35712 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX6P35712 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX6P35712 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX6P35712 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX6P35712 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX6P35712 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX6P35712 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX6P35712 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX6P35712 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX6P35712 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX6P35712 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX6P35712 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX6P35712 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX6P35712 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX6P35712 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX6P35712 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX6P35712 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX6P35712 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX6P35712 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX6P35712 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX6P35712 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX6P35712 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX6P35712 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX6P35712 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX6P35712 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX6P35712 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX6P35712 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX6P35712 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX6P35712 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX6P35712 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX6P35712 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX6P35712 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX6P35712 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX6P35712 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX6P35712 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX6P35712 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX6P35712 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX6P35712 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX6P35712 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX6P35712 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX6P35712 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX6P35712 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX6P35712 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX6P35712 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX6P35712 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms