Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYLC1P35663 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLC1P35663 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLC1P35663 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms