Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBSP35520 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSP35520 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSP35520 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSP35520 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSP35520 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSP35520 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSP35520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSP35520 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSP35520 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSP35520 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSP35520 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSP35520 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSP35520 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSP35520 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSP35520 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSP35520 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSP35520 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSP35520 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSP35520 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSP35520 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSP35520 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSP35520 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSP35520 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSP35520 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBSP35520 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBSP35520 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSP35520 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSP35520 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSP35520 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSP35520 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBSP35520 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSP35520 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSP35520 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSP35520 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSP35520 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSP35520 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSP35520 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSP35520 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSP35520 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSP35520 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSP35520 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSP35520 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSP35520 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSP35520 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSP35520 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSP35520 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSP35520 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSP35520 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBSP35520 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSP35520 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSP35520 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSP35520 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSP35520 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSP35520 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSP35520 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSP35520 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSP35520 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSP35520 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSP35520 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSP35520 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSP35520 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSP35520 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSP35520 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBSP35520 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBSP35520 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSP35520 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSP35520 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms