Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR1AP35321 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1AP35321 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms