Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFC1P35251 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFC1P35251 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFC1P35251 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFC1P35251 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFC1P35251 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFC1P35251 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFC1P35251 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFC1P35251 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFC1P35251 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFC1P35251 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFC1P35251 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFC1P35251 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFC1P35251 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFC1P35251 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFC1P35251 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFC1P35251 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFC1P35251 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC1P35251 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC1P35251 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC1P35251 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC1P35251 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC1P35251 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC1P35251 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC1P35251 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC1P35251 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC1P35251 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC1P35251 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC1P35251 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC1P35251 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC1P35251 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC1P35251 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC1P35251 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC1P35251 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC1P35251 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC1P35251 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC1P35251 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC1P35251 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC1P35251 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC1P35251 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC1P35251 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC1P35251 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC1P35251 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC1P35251 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC1P35251 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC1P35251 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC1P35251 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC1P35251 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC1P35251 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC1P35251 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC1P35251 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC1P35251 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC1P35251 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC1P35251 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC1P35251 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC1P35251 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC1P35251 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC1P35251 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC1P35251 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC1P35251 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC1P35251 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms