Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CA5AP35218 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CA5AP35218 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CA5AP35218 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CA5AP35218 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA5AP35218 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CA5AP35218 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA5AP35218 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA5AP35218 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CA5AP35218 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CA5AP35218 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA5AP35218 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA5AP35218 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA5AP35218 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA5AP35218 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA5AP35218 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA5AP35218 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA5AP35218 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA5AP35218 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA5AP35218 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA5AP35218 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA5AP35218 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA5AP35218 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA5AP35218 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA5AP35218 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA5AP35218 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA5AP35218 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA5AP35218 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA5AP35218 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA5AP35218 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA5AP35218 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA5AP35218 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA5AP35218 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CA5AP35218 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA5AP35218 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA5AP35218 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA5AP35218 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA5AP35218 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CA5AP35218 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA5AP35218 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA5AP35218 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CA5AP35218 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CA5AP35218 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CA5AP35218 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms