Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP2C19P33261 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C19P33261 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C19P33261 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C19P33261 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C19P33261 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms