Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A1P32418 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC8A1P32418 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC8A1P32418 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms