Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCKARP32238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCKARP32238 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCKARP32238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCKARP32238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCKARP32238 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCKARP32238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCKARP32238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCKARP32238 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCKARP32238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCKARP32238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCKARP32238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCKARP32238 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCKARP32238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCKARP32238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCKARP32238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCKARP32238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCKARP32238 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCKARP32238 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCKARP32238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCKARP32238 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCKARP32238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCKARP32238 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCKARP32238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCKARP32238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKARP32238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKARP32238 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKARP32238 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCKARP32238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKARP32238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKARP32238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKARP32238 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKARP32238 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCKARP32238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKARP32238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKARP32238 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKARP32238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCKARP32238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCKARP32238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCKARP32238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCKARP32238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKARP32238 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKARP32238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCKARP32238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms