Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UQCRC1P31930 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCRC1P31930 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UQCRC1P31930 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRC1P31930 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms