Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARID4AP29374 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID4AP29374 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARID4AP29374 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID4AP29374 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms