Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB2P29323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB2P29323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHB2P29323 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHB2P29323 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms