Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTX3P26022 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTX3P26022 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTX3P26022 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTX3P26022 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTX3P26022 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTX3P26022 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTX3P26022 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTX3P26022 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTX3P26022 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTX3P26022 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTX3P26022 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTX3P26022 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTX3P26022 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTX3P26022 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTX3P26022 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX3P26022 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX3P26022 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX3P26022 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTX3P26022 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTX3P26022 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTX3P26022 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTX3P26022 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTX3P26022 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTX3P26022 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTX3P26022 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTX3P26022 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTX3P26022 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTX3P26022 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTX3P26022 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTX3P26022 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTX3P26022 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTX3P26022 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTX3P26022 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTX3P26022 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTX3P26022 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTX3P26022 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTX3P26022 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms