Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR2AP24928 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR2AP24928 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR2AP24928 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR2AP24928 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms