Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A2P23975 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A2P23975 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A2P23975 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A2P23975 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms