Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.89□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 TM9SF2-203ENST00000466555 461 ntTSL 22.45□□□□□ -2.021e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 SLC25A3-209ENST00000548046 550 ntTSL 413.59□□□□□ -0.232e-13■■■■■ 45.2
RPS3P23396 SLC25A3-213ENST00000550695 756 ntTSL 313.44□□□□□ -0.262e-13■■■■■ 45.2
RPS3P23396 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-13■■■■■ 45.2
RPS3P23396 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.345e-48■■■■■ 45.2
RPS3P23396 LGALS1-206ENST00000480207 185 ntTSL 58.23□□□□□ -1.096e-20■■■■■ 45.1
RPS3P23396 SSR4-205ENST00000447375 427 ntTSL 212.08□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 45.1
RPS3P23396 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-27■■■■■ 45
RPS3P23396 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 45
RPS3P23396 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 45
RPS3P23396 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.347e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.37e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-207ENST00000470180 1861 ntTSL 516.84■□□□□ 0.297e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.227e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.067e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -07e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-27■■■■■ 44.9
RPS3P23396 C14orf2-206ENST00000554287 361 ntTSL 33.66□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 44.8
RPS3P23396 PLCD1-207ENST00000484829 1044 ntTSL 517.65■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 44.8
RPS3P23396 MAGED2-212ENST00000497484 990 ntTSL 214.62□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 44.8
RPS3P23396 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 212.17□□□□□ -0.461e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 58.18□□□□□ -1.11e-17■■■■■ 44.7
RPS3P23396 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 44.7
RPS3P23396 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 214.82□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 44.7
RPS3P23396 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 215.59■□□□□ 0.097e-16■■■■■ 44.4
RPS3P23396 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 213.33□□□□□ -0.287e-16■■■■■ 44.4
RPS3P23396 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 212.37□□□□□ -0.437e-16■■■■■ 44.4
RPS3P23396 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.187e-16■■■■■ 44.4
RPS3P23396 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-16■■■■■ 44.4
RPS3P23396 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-10■■■■■ 44.3
RPS3P23396 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 EIF4A3-205ENST00000575957 574 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-14■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-204ENST00000450711 991 ntTSL 313.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-207ENST00000497753 1072 ntTSL 513.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-203ENST00000435927 879 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-206ENST00000480519 1037 ntTSL 55.75□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 44.3
RPS3P23396 ITGA1-202ENST00000504086 1366 ntTSL 217.25■□□□□ 0.352e-23■■■■■ 44.2
RPS3P23396 PELO-202ENST00000506949 888 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-23■■■■■ 44.2
RPS3P23396 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-23■■■■■ 44.2
RPS3P23396 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-23■■■■■ 44.2
RPS3P23396 CCAR2-211ENST00000522599 1107 ntTSL 513.2□□□□□ -0.38e-8■■■■■ 44.1
RPS3P23396 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-13■■■■■ 44.1
RPS3P23396 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 44.1
RPS3P23396 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-13■■■■■ 44.1
RPS3P23396 FMC1-205ENST00000488886 432 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 FMC1-203ENST00000481123 460 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 FMC1-202ENST00000468383 345 ntTSL 313.54□□□□□ -0.242e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 FMC1-204ENST00000482181 386 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 311.05□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 44.1
RPS3P23396 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-15■■■■■ 44.1
RPS3P23396 NDUFB5-215ENST00000496904 175 ntTSL 58.2□□□□□ -1.17e-9■■■■■ 44
RPS3P23396 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 43.9
RPS3P23396 GPR107-207ENST00000493417 2833 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.373e-12■■■■■ 43.9
RPS3P23396 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-12■■■■■ 43.9
RPS3P23396 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-12■■■■■ 43.9
RPS3P23396 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.753e-12■■■■■ 43.9
RPS3P23396 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 43.8
RPS3P23396 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 43.7
RPS3P23396 INHA-202ENST00000489456 645 ntTSL 213.65□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 43.7
RPS3P23396 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 211.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 43.6
RPS3P23396 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 211.6□□□□□ -0.553e-21■■■■■ 43.4
RPS3P23396 HMBS-225ENST00000546302 707 ntTSL 515.65■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 43.3
RPS3P23396 HMBS-213ENST00000542345 882 ntTSL 36.77□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 43.3
RPS3P23396 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 43.3
RPS3P23396 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 515.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 43.3
RPS3P23396 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 43.2
RPS3P23396 AL928654.4-205ENST00000550554 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 43.2
RPS3P23396 AL928654.4-204ENST00000547184 460 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.46□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 43.2
RPS3P23396 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.99e-30■■■■■ 43.1
RPS3P23396 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.816e-12■■■■■ 43.1
RPS3P23396 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.146e-12■■■■■ 43.1
RPS3P23396 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-12■■■■■ 43.1
RPS3P23396 BCAT2-205ENST00000595376 2254 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 43
RPS3P23396 BCAT2-212ENST00000601681 1016 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 43
RPS3P23396 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 55.99□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 43
RPS3P23396 POLR3K-202ENST00000481810 907 ntTSL 213.01□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 43
RPS3P23396 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.244e-7■■■■■ 43
RPS3P23396 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 43
RPS3P23396 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 43
RPS3P23396 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 43
RPS3P23396 NDUFA9-202ENST00000396655 1037 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 NDUFA9-207ENST00000542369 548 ntTSL 410.14□□□□□ -0.797e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 AC005832.4-201ENST00000536588 818 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 NDUFA9-203ENST00000535050 512 ntTSL 38.96□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 NDUFA9-205ENST00000539573 500 ntTSL 38.33□□□□□ -1.087e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 NDUFA9-209ENST00000544679 782 ntTSL 28.33□□□□□ -1.087e-8■■■■■ 43
RPS3P23396 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 43
RPS3P23396 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 210.52□□□□□ -0.738e-13■■■■■ 42.8
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