Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEA1P23193 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA1P23193 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCEA1P23193 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA1P23193 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms