Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERBB3P21860 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ERBB3P21860 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB3P21860 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ERBB3P21860 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms