Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BGNP21810 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BGNP21810 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BGNP21810 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BGNP21810 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BGNP21810 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BGNP21810 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BGNP21810 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BGNP21810 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BGNP21810 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BGNP21810 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BGNP21810 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BGNP21810 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BGNP21810 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BGNP21810 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BGNP21810 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BGNP21810 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BGNP21810 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BGNP21810 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BGNP21810 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BGNP21810 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BGNP21810 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BGNP21810 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BGNP21810 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BGNP21810 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BGNP21810 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BGNP21810 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BGNP21810 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BGNP21810 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BGNP21810 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BGNP21810 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BGNP21810 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BGNP21810 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BGNP21810 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BGNP21810 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BGNP21810 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BGNP21810 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BGNP21810 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BGNP21810 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BGNP21810 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BGNP21810 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BGNP21810 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BGNP21810 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BGNP21810 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BGNP21810 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BGNP21810 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BGNP21810 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BGNP21810 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BGNP21810 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BGNP21810 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BGNP21810 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BGNP21810 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BGNP21810 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BGNP21810 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BGNP21810 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BGNP21810 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BGNP21810 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BGNP21810 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BGNP21810 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BGNP21810 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BGNP21810 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BGNP21810 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BGNP21810 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms