Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA5P20719 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA5P20719 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms