Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D1P20393 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D1P20393 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1D1P20393 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms