Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6AP20340 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6AP20340 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6AP20340 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6AP20340 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6AP20340 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6AP20340 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6AP20340 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6AP20340 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6AP20340 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6AP20340 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6AP20340 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB6AP20340 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB6AP20340 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6AP20340 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6AP20340 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6AP20340 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6AP20340 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms