Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B1P20020 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2B1P20020 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms