Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB5P18084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB5P18084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB5P18084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB5P18084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB5P18084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms