Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA1P17302 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA1P17302 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA1P17302 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA1P17302 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA1P17302 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA1P17302 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA1P17302 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA1P17302 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA1P17302 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA1P17302 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA1P17302 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA1P17302 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA1P17302 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA1P17302 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA1P17302 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA1P17302 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA1P17302 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA1P17302 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA1P17302 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA1P17302 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA1P17302 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA1P17302 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA1P17302 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA1P17302 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA1P17302 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA1P17302 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA1P17302 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA1P17302 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA1P17302 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA1P17302 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA1P17302 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA1P17302 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA1P17302 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA1P17302 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA1P17302 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA1P17302 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA1P17302 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA1P17302 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA1P17302 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA1P17302 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA1P17302 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA1P17302 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA1P17302 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA1P17302 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJA1P17302 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJA1P17302 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJA1P17302 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA1P17302 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA1P17302 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA1P17302 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms