Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCAP17252 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCAP17252 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms