Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SELPP16109 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELPP16109 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELPP16109 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELPP16109 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SELPP16109 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELPP16109 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SELPP16109 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELPP16109 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELPP16109 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SELPP16109 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELPP16109 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELPP16109 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SELPP16109 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SELPP16109 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SELPP16109 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SELPP16109 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SELPP16109 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SELPP16109 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SELPP16109 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELPP16109 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELPP16109 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELPP16109 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELPP16109 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELPP16109 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELPP16109 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELPP16109 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELPP16109 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELPP16109 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SELPP16109 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELPP16109 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SELPP16109 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELPP16109 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SELPP16109 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELPP16109 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELPP16109 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELPP16109 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SELPP16109 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELPP16109 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELPP16109 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELPP16109 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELPP16109 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SELPP16109 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELPP16109 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELPP16109 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELPP16109 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SELPP16109 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SELPP16109 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELPP16109 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SELPP16109 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELPP16109 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SELPP16109 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SELPP16109 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELPP16109 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELPP16109 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELPP16109 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SELPP16109 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SELPP16109 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SELPP16109 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SELPP16109 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SELPP16109 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SELPP16109 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SELPP16109 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SELPP16109 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms