Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCSHP14314 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCSHP14314 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCSHP14314 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCSHP14314 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms