Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-EP13747 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-EP13747 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-EP13747 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms