Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRYGAP11844 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYGAP11844 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGAP11844 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms