Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK4P11802 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK4P11802 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK4P11802 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK4P11802 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK4P11802 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK4P11802 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK4P11802 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK4P11802 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK4P11802 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK4P11802 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK4P11802 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK4P11802 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK4P11802 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK4P11802 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK4P11802 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK4P11802 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK4P11802 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK4P11802 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK4P11802 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK4P11802 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK4P11802 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK4P11802 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK4P11802 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK4P11802 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK4P11802 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK4P11802 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK4P11802 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK4P11802 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK4P11802 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK4P11802 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK4P11802 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK4P11802 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK4P11802 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK4P11802 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK4P11802 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK4P11802 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK4P11802 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK4P11802 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK4P11802 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK4P11802 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK4P11802 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK4P11802 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK4P11802 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK4P11802 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK4P11802 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK4P11802 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK4P11802 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK4P11802 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK4P11802 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK4P11802 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms