Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGBP11216 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGBP11216 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGBP11216 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGBP11216 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGBP11216 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGBP11216 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGBP11216 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGBP11216 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGBP11216 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGBP11216 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGBP11216 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYGBP11216 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYGBP11216 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYGBP11216 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGBP11216 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGBP11216 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGBP11216 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGBP11216 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGBP11216 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGBP11216 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGBP11216 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGBP11216 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGBP11216 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGBP11216 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGBP11216 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYGBP11216 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PYGBP11216 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYGBP11216 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGBP11216 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGBP11216 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGBP11216 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYGBP11216 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYGBP11216 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYGBP11216 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYGBP11216 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYGBP11216 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYGBP11216 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PYGBP11216 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PYGBP11216 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PYGBP11216 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PYGBP11216 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PYGBP11216 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PYGBP11216 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PYGBP11216 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PYGBP11216 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PYGBP11216 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PYGBP11216 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PYGBP11216 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYGBP11216 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYGBP11216 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYGBP11216 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYGBP11216 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYGBP11216 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYGBP11216 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PYGBP11216 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PYGBP11216 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PYGBP11216 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms