Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HKR1P10072 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HKR1P10072 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HKR1P10072 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HKR1P10072 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HKR1P10072 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HKR1P10072 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HKR1P10072 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HKR1P10072 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HKR1P10072 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HKR1P10072 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HKR1P10072 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HKR1P10072 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HKR1P10072 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HKR1P10072 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HKR1P10072 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HKR1P10072 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HKR1P10072 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HKR1P10072 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HKR1P10072 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HKR1P10072 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HKR1P10072 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HKR1P10072 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HKR1P10072 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HKR1P10072 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HKR1P10072 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HKR1P10072 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HKR1P10072 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HKR1P10072 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HKR1P10072 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HKR1P10072 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HKR1P10072 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HKR1P10072 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HKR1P10072 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HKR1P10072 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HKR1P10072 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HKR1P10072 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HKR1P10072 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HKR1P10072 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HKR1P10072 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HKR1P10072 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HKR1P10072 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1143.9 ms