Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBSLP0DN79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBSLP0DN79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBSLP0DN79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms