Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD3P0DMS9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIGD3P0DMS9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD3P0DMS9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms