Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA4P0DJD7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA4P0DJD7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA4P0DJD7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGA4P0DJD7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms