Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2MP0CAP2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2MP0CAP2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR2MP0CAP2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2MP0CAP2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms