Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1AP08908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1AP08908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms