Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT18P05783 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT18P05783 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT18P05783 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT18P05783 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT18P05783 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT18P05783 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT18P05783 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT18P05783 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT18P05783 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT18P05783 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT18P05783 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT18P05783 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT18P05783 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT18P05783 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT18P05783 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT18P05783 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT18P05783 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT18P05783 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT18P05783 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT18P05783 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT18P05783 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT18P05783 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT18P05783 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT18P05783 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT18P05783 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT18P05783 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT18P05783 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT18P05783 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT18P05783 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT18P05783 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT18P05783 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT18P05783 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT18P05783 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT18P05783 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT18P05783 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT18P05783 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT18P05783 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT18P05783 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT18P05783 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT18P05783 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT18P05783 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT18P05783 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT18P05783 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT18P05783 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT18P05783 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT18P05783 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT18P05783 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT18P05783 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT18P05783 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT18P05783 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT18P05783 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT18P05783 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT18P05783 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT18P05783 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT18P05783 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT18P05783 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT18P05783 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT18P05783 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT18P05783 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT18P05783 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT18P05783 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms